Departamentet:
Etnologji
Histori
Histori e artit
Laboratori qendror i konservimit
Qendra për edukim
Departamenti i evidencës dhe dokumentacionit muzeal
Departamenti i punëve profesionale-teknike
Departamenti i udhërrëfimit muzeal
Departamenti i punëve juridike dhe administrative
Departamenti i menaxhimit me burimet njerëzore
Departamenti i mbrojtjes, shpëtimit dhe menaxhimit me kriza
Departamenti i punëve financiare dhe kontabilitetit